Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2MP0CAP2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR2MP0CAP2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms