Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PATE4P0C8F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATE4P0C8F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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