Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFPTP0C1Z6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFPTP0C1Z6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFPTP0C1Z6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms