Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHCP07864 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHCP07864 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHCP07864 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDHCP07864 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHCP07864 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHCP07864 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHCP07864 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHCP07864 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHCP07864 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHCP07864 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHCP07864 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHCP07864 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHCP07864 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHCP07864 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHCP07864 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHCP07864 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHCP07864 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHCP07864 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHCP07864 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHCP07864 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHCP07864 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHCP07864 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHCP07864 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHCP07864 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHCP07864 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHCP07864 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHCP07864 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHCP07864 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHCP07864 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.58■■■□□ 2
LDHCP07864 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHCP07864 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHCP07864 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHCP07864 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHCP07864 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHCP07864 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHCP07864 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LDHCP07864 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LDHCP07864 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LDHCP07864 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LDHCP07864 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LDHCP07864 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHCP07864 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHCP07864 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHCP07864 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LDHCP07864 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LDHCP07864 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHCP07864 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHCP07864 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHCP07864 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDHCP07864 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHCP07864 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms