Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMP06732 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMP06732 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMP06732 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMP06732 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMP06732 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMP06732 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMP06732 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMP06732 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMP06732 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMP06732 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMP06732 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMP06732 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMP06732 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMP06732 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMP06732 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMP06732 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMP06732 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMP06732 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMP06732 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMP06732 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKMP06732 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKMP06732 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKMP06732 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKMP06732 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKMP06732 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKMP06732 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMP06732 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMP06732 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMP06732 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMP06732 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMP06732 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMP06732 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMP06732 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMP06732 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMP06732 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMP06732 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMP06732 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMP06732 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CKMP06732 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CKMP06732 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKMP06732 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKMP06732 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms