Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGRP06401 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGRP06401 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGRP06401 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGRP06401 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGRP06401 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGRP06401 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGRP06401 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGRP06401 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGRP06401 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGRP06401 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGRP06401 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGRP06401 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGRP06401 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGRP06401 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGRP06401 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGRP06401 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGRP06401 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGRP06401 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PGRP06401 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGRP06401 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGRP06401 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGRP06401 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGRP06401 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGRP06401 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGRP06401 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGRP06401 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGRP06401 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGRP06401 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGRP06401 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGRP06401 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PGRP06401 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGRP06401 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGRP06401 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGRP06401 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGRP06401 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGRP06401 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGRP06401 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGRP06401 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGRP06401 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGRP06401 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGRP06401 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGRP06401 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGRP06401 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PGRP06401 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGRP06401 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGRP06401 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGRP06401 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms