Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB1P05556 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB1P05556 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB1P05556 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms