Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms