Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX18O95935 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX18O95935 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX18O95935 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX18O95935 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX18O95935 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX18O95935 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX18O95935 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX18O95935 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX18O95935 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX18O95935 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX18O95935 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX18O95935 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX18O95935 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX18O95935 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX18O95935 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX18O95935 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX18O95935 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX18O95935 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX18O95935 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX18O95935 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX18O95935 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX18O95935 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX18O95935 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TBX18O95935 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX18O95935 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX18O95935 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX18O95935 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX18O95935 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX18O95935 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX18O95935 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX18O95935 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX18O95935 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX18O95935 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX18O95935 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX18O95935 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX18O95935 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX18O95935 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX18O95935 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX18O95935 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX18O95935 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX18O95935 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX18O95935 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX18O95935 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms