Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF12O95522 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF12O95522 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms