Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPBO95292 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPBO95292 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPBO95292 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPBO95292 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAPBO95292 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAPBO95292 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAPBO95292 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAPBO95292 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPBO95292 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPBO95292 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPBO95292 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPBO95292 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAPBO95292 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAPBO95292 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAPBO95292 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAPBO95292 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPBO95292 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPBO95292 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPBO95292 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPBO95292 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPBO95292 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAPBO95292 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAPBO95292 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPBO95292 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPBO95292 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPBO95292 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAPBO95292 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAPBO95292 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAPBO95292 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms