Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD4O95243 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD4O95243 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD4O95243 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD4O95243 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD4O95243 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD4O95243 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD4O95243 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD4O95243 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD4O95243 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD4O95243 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MBD4O95243 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD4O95243 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD4O95243 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD4O95243 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD4O95243 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD4O95243 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD4O95243 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD4O95243 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD4O95243 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD4O95243 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD4O95243 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD4O95243 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MBD4O95243 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MBD4O95243 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD4O95243 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MBD4O95243 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MBD4O95243 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD4O95243 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MBD4O95243 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD4O95243 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD4O95243 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD4O95243 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD4O95243 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD4O95243 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD4O95243 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD4O95243 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD4O95243 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD4O95243 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD4O95243 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD4O95243 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD4O95243 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MBD4O95243 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MBD4O95243 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MBD4O95243 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD4O95243 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD4O95243 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MBD4O95243 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD4O95243 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD4O95243 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MBD4O95243 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD4O95243 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD4O95243 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD4O95243 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD4O95243 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD4O95243 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms