Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX4O95219 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX4O95219 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX4O95219 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX4O95219 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX4O95219 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX4O95219 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX4O95219 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX4O95219 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX4O95219 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX4O95219 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX4O95219 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX4O95219 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX4O95219 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX4O95219 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX4O95219 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX4O95219 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX4O95219 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX4O95219 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX4O95219 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX4O95219 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX4O95219 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX4O95219 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX4O95219 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX4O95219 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX4O95219 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX4O95219 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX4O95219 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX4O95219 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX4O95219 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX4O95219 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX4O95219 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX4O95219 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX4O95219 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX4O95219 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX4O95219 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX4O95219 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX4O95219 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX4O95219 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX4O95219 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX4O95219 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX4O95219 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms