Protein–RNA interactions for Protein: O94941

UBOX5, RING finger protein 37, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBOX5O94941 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBOX5O94941 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBOX5O94941 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms