Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN5O94779 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN5O94779 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms