Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALMO75781 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PALMO75781 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMO75781 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMO75781 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMO75781 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMO75781 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMO75781 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMO75781 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALMO75781 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALMO75781 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALMO75781 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALMO75781 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALMO75781 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALMO75781 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALMO75781 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALMO75781 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALMO75781 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALMO75781 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALMO75781 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMO75781 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALMO75781 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALMO75781 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALMO75781 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALMO75781 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALMO75781 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms