Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CILPO75339 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CILPO75339 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CILPO75339 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CILPO75339 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CILPO75339 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CILPO75339 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CILPO75339 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CILPO75339 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CILPO75339 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CILPO75339 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CILPO75339 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CILPO75339 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CILPO75339 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CILPO75339 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CILPO75339 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CILPO75339 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CILPO75339 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CILPO75339 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CILPO75339 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CILPO75339 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CILPO75339 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CILPO75339 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CILPO75339 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CILPO75339 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CILPO75339 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CILPO75339 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CILPO75339 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CILPO75339 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CILPO75339 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CILPO75339 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CILPO75339 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CILPO75339 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CILPO75339 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CILPO75339 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CILPO75339 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CILPO75339 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CILPO75339 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CILPO75339 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms