Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP9AO75110 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9AO75110 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9AO75110 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms