Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP4O75096 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP4O75096 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP4O75096 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP4O75096 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP4O75096 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP4O75096 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP4O75096 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRP4O75096 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP4O75096 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP4O75096 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP4O75096 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP4O75096 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP4O75096 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRP4O75096 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRP4O75096 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP4O75096 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP4O75096 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP4O75096 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP4O75096 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP4O75096 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP4O75096 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP4O75096 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRP4O75096 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRP4O75096 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP4O75096 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP4O75096 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRP4O75096 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRP4O75096 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRP4O75096 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP4O75096 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP4O75096 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP4O75096 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRP4O75096 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRP4O75096 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRP4O75096 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP4O75096 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP4O75096 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP4O75096 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRP4O75096 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP4O75096 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP4O75096 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP4O75096 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP4O75096 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP4O75096 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP4O75096 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP4O75096 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRP4O75096 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms