Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP3O75074 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP3O75074 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP3O75074 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP3O75074 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP3O75074 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP3O75074 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP3O75074 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP3O75074 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP3O75074 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP3O75074 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP3O75074 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP3O75074 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP3O75074 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP3O75074 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP3O75074 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP3O75074 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP3O75074 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP3O75074 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRP3O75074 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRP3O75074 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP3O75074 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP3O75074 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP3O75074 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP3O75074 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP3O75074 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP3O75074 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP3O75074 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP3O75074 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP3O75074 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms