Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MARCH6O60337 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH6O60337 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms