Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BNIP3LO60238 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNIP3LO60238 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms