Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3O43889 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3O43889 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3O43889 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3O43889 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3O43889 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3O43889 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3O43889 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3O43889 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3O43889 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3O43889 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3O43889 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3O43889 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3O43889 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3O43889 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3O43889 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3O43889 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CREB3O43889 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3O43889 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3O43889 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3O43889 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3O43889 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3O43889 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3O43889 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3O43889 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3O43889 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3O43889 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3O43889 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3O43889 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3O43889 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3O43889 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3O43889 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3O43889 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3O43889 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3O43889 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3O43889 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3O43889 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3O43889 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms