Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDIL3O43854 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDIL3O43854 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDIL3O43854 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms