Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR2O43760 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYNGR2O43760 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms