Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF4O43474 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF4O43474 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF4O43474 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF4O43474 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF4O43474 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF4O43474 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF4O43474 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF4O43474 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLF4O43474 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLF4O43474 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF4O43474 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF4O43474 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF4O43474 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF4O43474 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF4O43474 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF4O43474 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF4O43474 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF4O43474 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF4O43474 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF4O43474 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF4O43474 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF4O43474 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF4O43474 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLF4O43474 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF4O43474 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF4O43474 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF4O43474 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF4O43474 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF4O43474 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF4O43474 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF4O43474 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF4O43474 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF4O43474 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF4O43474 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF4O43474 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF4O43474 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF4O43474 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF4O43474 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms