Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERI3O43414 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ERI3O43414 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERI3O43414 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERI3O43414 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERI3O43414 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERI3O43414 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERI3O43414 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERI3O43414 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERI3O43414 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERI3O43414 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERI3O43414 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERI3O43414 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERI3O43414 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERI3O43414 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERI3O43414 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERI3O43414 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERI3O43414 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERI3O43414 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERI3O43414 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERI3O43414 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERI3O43414 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERI3O43414 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERI3O43414 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERI3O43414 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERI3O43414 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERI3O43414 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERI3O43414 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERI3O43414 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERI3O43414 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERI3O43414 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERI3O43414 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERI3O43414 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ERI3O43414 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERI3O43414 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERI3O43414 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERI3O43414 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERI3O43414 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERI3O43414 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERI3O43414 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERI3O43414 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERI3O43414 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERI3O43414 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERI3O43414 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERI3O43414 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERI3O43414 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERI3O43414 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERI3O43414 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms