Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA2O43364 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA2O43364 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA2O43364 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms