Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2DO15514 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms