Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPHP1O15259 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NPHP1O15259 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NPHP1O15259 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms