Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNPHO15079 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNPHO15079 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNPHO15079 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNPHO15079 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNPHO15079 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNPHO15079 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNPHO15079 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNPHO15079 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNPHO15079 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNPHO15079 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNPHO15079 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNPHO15079 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNPHO15079 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNPHO15079 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNPHO15079 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNPHO15079 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNPHO15079 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNPHO15079 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNPHO15079 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNPHO15079 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms