Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNMO15061 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNMO15061 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNMO15061 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNMO15061 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNMO15061 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNMO15061 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNMO15061 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNMO15061 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNMO15061 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNMO15061 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYNMO15061 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNMO15061 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNMO15061 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNMO15061 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYNMO15061 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNMO15061 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNMO15061 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYNMO15061 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNMO15061 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNMO15061 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNMO15061 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNMO15061 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYNMO15061 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNMO15061 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNMO15061 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNMO15061 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNMO15061 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYNMO15061 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SYNMO15061 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNMO15061 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNMO15061 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNMO15061 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYNMO15061 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNMO15061 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNMO15061 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYNMO15061 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNMO15061 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNMO15061 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNMO15061 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNMO15061 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNMO15061 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNMO15061 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SYNMO15061 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNMO15061 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNMO15061 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNMO15061 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNMO15061 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNMO15061 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNMO15061 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNMO15061 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYNMO15061 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNMO15061 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNMO15061 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYNMO15061 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNMO15061 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNMO15061 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNMO15061 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNMO15061 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNMO15061 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYNMO15061 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYNMO15061 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYNMO15061 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYNMO15061 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYNMO15061 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYNMO15061 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYNMO15061 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYNMO15061 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYNMO15061 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYNMO15061 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYNMO15061 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYNMO15061 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYNMO15061 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYNMO15061 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYNMO15061 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYNMO15061 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYNMO15061 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYNMO15061 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYNMO15061 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYNMO15061 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYNMO15061 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYNMO15061 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYNMO15061 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYNMO15061 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYNMO15061 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYNMO15061 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYNMO15061 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYNMO15061 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYNMO15061 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYNMO15061 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms