Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLGNO14967 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLGNO14967 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLGNO14967 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLGNO14967 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLGNO14967 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLGNO14967 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLGNO14967 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLGNO14967 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLGNO14967 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLGNO14967 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLGNO14967 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLGNO14967 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLGNO14967 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLGNO14967 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLGNO14967 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLGNO14967 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLGNO14967 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLGNO14967 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLGNO14967 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLGNO14967 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLGNO14967 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLGNO14967 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLGNO14967 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLGNO14967 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLGNO14967 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLGNO14967 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLGNO14967 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms