Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP56O00567 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP56O00567 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP56O00567 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP56O00567 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP56O00567 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOP56O00567 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP56O00567 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP56O00567 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOP56O00567 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP56O00567 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP56O00567 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP56O00567 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP56O00567 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP56O00567 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP56O00567 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP56O00567 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOP56O00567 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOP56O00567 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP56O00567 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP56O00567 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP56O00567 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP56O00567 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP56O00567 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP56O00567 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP56O00567 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOP56O00567 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP56O00567 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOP56O00567 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP56O00567 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP56O00567 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP56O00567 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP56O00567 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP56O00567 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP56O00567 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP56O00567 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP56O00567 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP56O00567 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP56O00567 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP56O00567 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NOP56O00567 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP56O00567 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP56O00567 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP56O00567 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP56O00567 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP56O00567 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms