Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KPNA3O00505 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KPNA3O00505 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms