Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR4O00206 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR4O00206 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR4O00206 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR4O00206 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR4O00206 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR4O00206 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR4O00206 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR4O00206 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR4O00206 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR4O00206 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR4O00206 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR4O00206 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR4O00206 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR4O00206 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR4O00206 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR4O00206 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR4O00206 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR4O00206 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR4O00206 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR4O00206 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR4O00206 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR4O00206 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR4O00206 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR4O00206 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR4O00206 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR4O00206 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR4O00206 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR4O00206 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR4O00206 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR4O00206 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR4O00206 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR4O00206 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR4O00206 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR4O00206 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR4O00206 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR4O00206 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR4O00206 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR4O00206 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR4O00206 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR4O00206 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR4O00206 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR4O00206 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR4O00206 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms