Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QKU1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QKU1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QKU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QKU1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QKU1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QKU1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QKU1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QKU1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QKU1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QKU1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QKU1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QKU1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QKU1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QKU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QKU1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QKU1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QKU1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QKU1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QKU1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QKU1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QKU1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QKU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QKU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QKU1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QKU1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QKU1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QKU1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QKU1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QKU1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QKU1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QKU1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QKU1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QKU1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QKU1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QKU1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QKU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QKU1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QKU1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QKU1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QKU1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QKU1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QKU1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QKU1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QKU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QKU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QKU1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QKU1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QKU1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QKU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QKU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QKU1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QKU1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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