Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1D1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1D1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1D1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1D1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1D1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1D1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1D1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
H7C1D1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
H7C1D1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1D1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1D1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1D1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1D1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1D1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1D1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1D1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1D1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1D1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
H7C1D1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1D1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1D1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1D1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1D1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1D1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1D1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1D1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1D1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1D1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1D1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1D1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1D1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1D1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1D1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1D1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1D1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1D1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1D1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1D1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1D1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1D1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1D1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1D1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1D1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1D1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1D1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1D1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1D1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1D1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1D1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1D1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1D1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1D1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1D1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1D1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1D1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1D1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1D1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1D1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1D1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1D1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1D1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1D1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1D1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms