Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H3BRM9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H3BRM9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H3BRM9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H3BRM9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H3BRM9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H3BRM9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3BRM9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3BRM9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3BRM9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3BRM9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3BRM9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3BRM9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H3BRM9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H3BRM9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H3BRM9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms