Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf58C9J3I9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf58C9J3I9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms