Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCA1A8K7I4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCA1A8K7I4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms