Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6L4A6NEF3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L4A6NEF3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms