Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT1A5YKK6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms