Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB19A4D1S5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB19A4D1S5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms