Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM89A2RUT3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM89A2RUT3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms