Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTL3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTL3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1B0GTL3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1B0GTL3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms