Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0J9YY10 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YY10 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YY10 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms