Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms