Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP3K4Q9Y6R4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms