Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP15Q9Y4E8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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